Markus Prause wurde in Wien geboren und erhielt ab dem 5. Lebensjahr Klavierunterricht. Er schloss sein Klavier-Konzertfachstudium am Konservatorium für Musik und dramatische Kunst in Wien in der Klasse des künstlerischen Direktors Horst Leichtfried ab.Er setzte seine Ausbildung in Kursen und privaten Studien bei Adam Harasiewicz (Polen), Edith Picht-Axenfeld (Deutschland) und Dr. Josef Dichler (Wien) fort und absolvierte postgraduale und laufende Weiterbildung bei international anerkannten Musikern, wie Prof. Walter Fleischmann (Wien) und Sergej Maltsev (St. Petersburg). Prof. Prause erhielt mehrfach Preise bei nationalen und internationalen Wettbewerben, darunter den 1.Preis und Bösendorfer Sonderpreis beim Österreichischen Bundeswettbewerb „Jugend musiziert”

Sein Lehrer war Edwin Fischer, sein Entdecker Wilhelm Furtwängler. Sein Komponistenfreund, Frank Martin, schrieb ein Klavierkonzert für ihn, und er pflegte eine professionelle Freundschaft mit dem großen russischen Violinisten David Oistrach.
Paul Badura-Skoda ist schon lange ein Symbol für die Kultivierung der Wiener klassischen Musik. Als Träger des prestigeträchtigen Bösendorfer-Rings ist er ein viel gefeierter Gast bei großen internationalen Musikveranstaltungen.